Sammendrag
Biomarks er et tverrfaglig EU prosjekt med 8 europeiske partnere med eksperter innen marinbiologi, protistologi, økologi, molekylærbiologi, bioinformatikk som utforsker biodiversiteten av encellede eukaryoter (protister) i europeiske kystfarvann (bla Oslofjorden) . Diversiteten undersøkes vha moderne molekylærbiologiske metoder (454-sekvensering) og sammenlignes med mikroskopering. Mønster i diversiteten undersøkes ved å sammenholde taksonomisk/gen-sammensetning med karakteristikken av miljøforholdene (næringssalter, temperatur, saltholdighet, lys, algepigmenter osv). Målet er å oppdage nye skjeldne organismer og grener på livets tre, bedre forstå planktonets diversitet, sammensetning og utbredelse og hvilke miljøfaktorer som styrer diversiteteten og den rådende taksonomiske sammensetningen.
Vis fullstendig beskrivelse
Vitenskapelig sammendrag
Biomarks er et tverrfaglig EU prosjekt med 8 europeiske partnere med eksperter innen marinbiologi, protistologi, økologi, molekylærbiologi, bioinformatikk som utforsker biodiversiteten av encellede eukaryoter (protister) i europeiske kystfarvann (bla Oslofjorden) . Diversiteten undersøkes vha moderne molekylærbiologiske metoder (454-sekvensering) og sammenlignes med mikroskopering. Mønster i diversiteten undersøkes ved å sammenholde taksonomisk/gen-sammensetning med karakteristikken av miljøforholdene (næringssalter, temperatur, saltholdighet, lys, algepigmenter osv). Målet er å oppdage nye skjeldne organismer og grener på livets tre, bedre forstå planktonets diversitet, sammensetning og utbredelse og hvilke miljøfaktorer som styrer diversiteteten og den rådende taksonomiske sammensetningen.
Vis fullstendig beskrivelse
Metode
1. water sampling and physic-chemical measurements on board research vessel, 2. oncentration of size fractioned samples by filtration and ultrafiltration, 3. fixation for microscopy and freezing filters for nucleotides.4. RNA and DNA extraction, PCR, 5. 454-sequencing (NGS), 6. bioinformatics of NGS data7. multivariate statistical analyses
Utstyr
research vessel Trygve Braarud and instruments and sampling equipment on board (CTD, Niskin water samplers, light meter, plankton nets, filtration equipments), molecular biological lab, light and electron microscopes, 454 sequencer
