Sammendrag
Kjemoautotrofe ammoniakk-oksidierande bakterier (AOB) er dei einaste
organismane som i signifikant grad oksidererammoniakk til nitritt, det forste
steget i nitrifikasjon, ein hoveddel av nitrogensyklus. AOB er lite studerte,
på grunn av sein vekst og lågt vekstutbyte. Molekylærbiologiske metodar har
gjort det mogeleg å karakterisera naturlege AOB-populasjonar og kartleggja
aktivitetane deira. Me ønskjerå vidareutvikla desse metodane, og me vil, i
tillegg, arbeida med å etablera nye teknikkar (t.d. kvantivtativ PCR med
fluorecens-merka oligonukleotid og fluorsecent in situ hybridisering (FISH).
Dette arbeidet bli bli jamført med karakterisering av nye reinkulturar av AOB.
Isolering av AOB-reinkulturar har vore nedprioritert av mange grupper, men
erframleis svært viktig, sidan samlinga av AOB-reinkulturar i dag er begrensa,
og fordi karakterisering av nye isolat vil vera viktig for å vurdera
kvaliteten av arbeidet med molekylærbiologiska metoder for karakterisering av
naturlege populasjonar. Svært få studium av grunnleggjande molekylærbiologi
hos AOB har blitt utførte til no. I dette prosjektet ønsjer me å
karakterisera sentrale operon (hydroksylamin-oksidoreduktase, rrn) primært hos
Nitrosospira-isolat. Vidare vil en hva promoter-probe-vektorar karakterisera
promoter-element hos ein eller fleire Nitrosospira spp.
Vis fullstendig beskrivelse
Vitenskapelig sammendrag
Kjemoautotrofe ammoniakk-oksidierande bakterier (AOB) er dei einaste
organismane som i signifikant grad oksidererammoniakk til nitritt, det forste
steget i nitrifikasjon, ein hoveddel av nitrogensyklus. AOB er lite studerte,
på grunn av sein vekst og lågt vekstutbyte. Molekylærbiologiske metodar har
gjort det mogeleg å karakterisera naturlege AOB-populasjonar og kartleggja
aktivitetane deira. Me ønskjerå vidareutvikla desse metodane, og me vil, i
tillegg, arbeida med å etablera nye teknikkar (t.d. kvantivtativ PCR med
fluorecens-merka oligonukleotid og fluorsecent in situ hybridisering (FISH).
Dette arbeidet bli bli jamført med karakterisering av nye reinkulturar av AOB.
Isolering av AOB-reinkulturar har vore nedprioritert av mange grupper, men
erframleis svært viktig, sidan samlinga av AOB-reinkulturar i dag er begrensa,
og fordi karakterisering av nye isolat vil vera viktig for å vurdera
kvaliteten av arbeidet med molekylærbiologiska metoder for karakterisering av
naturlege populasjonar. Svært få studium av grunnleggjande molekylærbiologi
hos AOB har blitt utførte til no. I dette prosjektet ønsjer me å
karakterisera sentrale operon (hydroksylamin-oksidoreduktase, rrn) primært hos
Nitrosospira-isolat. Vidare vil en hva promoter-probe-vektorar karakterisera
promoter-element hos ein eller fleire Nitrosospira spp.
Vis fullstendig beskrivelse