Cristin-prosjekt-ID: 484457
Sist endret: 24. august 2019, 08:42

Cristin-prosjekt-ID: 484457
Sist endret: 24. august 2019, 08:42
Prosjekt

Environmental Barcoding of Aquatic Invertebrates (EBAI)

prosjektleder

Torbjørn Ekrem
ved Institutt for naturhistorie ved Norges teknisk-naturvitenskapelige universitet

prosjekteier / koordinerende forskningsansvarlig enhet

  • NTNU Vitenskapsmuseet ved Norges teknisk-naturvitenskapelige universitet

Finansiering

  • TotalbudsjettNOK 9.377.000
  • Norges forskningsråd
    Prosjektkode: 243791/E50
  • Miljødirektoratet
    Prosjektkode: 15040013

Klassifisering

Vitenskapsdisipliner

Økologi • Miljøteknologi

Emneord

Miljø • Ferskvannsanalyse • Biologisk mangfold • Ferskvannsinsekter • Ferskvannsbiota • Miljøundersøkelse • Bevaringsbiologi

Kategorier

Prosjektkategori

  • Bidragsprosjekt

Tidsramme

Avsluttet
Start: 1. august 2015 Slutt: 30. mai 2019

Beskrivelse Beskrivelse

Tittel

Environmental Barcoding of Aquatic Invertebrates (EBAI)

Populærvitenskapelig sammendrag

Freshwater ecosystems represent an irreplaceable natural resource and are heavily influenced by human activities. These ecosystems hold almost 100 000 species, 6% of all described diversity. Many of these species are not used in monitoring programs since the identification of cryptic, diverse and taxonomically difficult organism-groups (e.g. invertebrates) often is both costly and challenging. However, by using short, standardised DNA fragments and Next Generation Sequencing (NGS) techniques, species in environmental samples can be effectively identified. This method can potentially revolutionize the way we assess and monitor biodiversity in freshwater ecosystems and environmental barcoding can become an effective tool for Norway and other European countries seeking to fulfil their commitment to the European Commission Water Framework Directive. The field of environmental barcoding has seen tremendous progress in methodology over the last decade, but protocols for actual implementation as well as regional reference libraries remain to be developed and rigorously tested before assigning barcoding in large-scale measures for biomonitoring. In this project we wish to advance such protocols by analysis of environmental and historical samples from the reference watershed Atna and Lake Jonsvatnet in Central Norway. Our aim is to develop general best-practice procedures to maximise the effectiveness and accuracy of species-level identification at minimum cost using next generation sequencing techniques.

prosjektdeltakere

prosjektleder
Aktiv cristin-person

Torbjørn Ekrem

  • Tilknyttet:
    Prosjektleder
    ved Institutt for naturhistorie ved Norges teknisk-naturvitenskapelige universitet

Markus Majaneva

  • Tilknyttet:
    Prosjektdeltaker
    ved Institutt for naturhistorie ved Norges teknisk-naturvitenskapelige universitet

Elisabeth Stur

  • Tilknyttet:
    Prosjektdeltaker
    ved Institutt for naturhistorie ved Norges teknisk-naturvitenskapelige universitet

Terje Bongard

  • Tilknyttet:
    Prosjektdeltaker
    ved NINA akvatisk naturmangfold ved Norsk institutt for naturforskning

Anders Hobæk

  • Tilknyttet:
    Prosjektdeltaker
    ved Institutt for biovitenskap ved Universitetet i Bergen
  • Tilknyttet:
    Prosjektdeltaker
    ved Ferskvannsøkologi ved Norsk institutt for vannforskning
1 - 5 av 10 | Neste | Siste »

Resultater Resultater

DNA-metastrekkoding til undersøkelser av invertebrater i ferskvann.

Ekrem, Torbjørn; Majaneva, Markus. 2019, NTNURapport

Kan vi bruke DNA-teknologi til biologisk overvåkning i vann?

Ekrem, Torbjørn. 2019, Nasjonal vannmiljøkonferanse. NTNUFaglig foredrag

Advancing the use of molecular methods for routine freshwater macroinvertebrate biomonitoring – the need for calibration experiments.

Blackman, Rosetta C.; Mächler, Elvira; Altermatt, Florian; Arnold, Amanda; Beja, Pedro; Boets, Pieter; Egeter, Bastian; Elbrecht, Vasco; Filipe, Ana Filipa; Jones, J. Iwan mfl.. 2019, Metabarcoding and Metagenomics. UdP, UZ, IGB, SYKE, NTNU, EAWAG, UOG, NATURALIS, UB, UG, NHM, UNIDUISB, QMUL, UdG, ULISBOAVitenskapelig artikkel

A barcode gap analysis for aquatic biomonitoring in Europe.

Weigand, Hannah; Beermann, Arne J.; Čiampor, Fedor; Costa, Filipe O.; Csabai, Zoltán; Duarte, Sofia; Geiger, Matthias F.; Grabowski, Michał; Rimet, Frédéric; Rulik, Björn mfl.. 2019, 8th International Barcode of Life Conference. NTNU, UIBPoster

The effect of rotenone on protist community composition in freshwater lakes.

Majaneva, Markus; Fonseca, Vera G.; Ekrem, Torbjørn. 2019, Genome. ZFMK, NTNUSammendrag/abstract
1 - 5 av 25 | Neste | Siste »