Cristin-resultat-ID: 1824132
Sist endret: 22. februar 2021, 11:10
NVI-rapporteringsår: 2020
Resultat
Vitenskapelig artikkel
2020

Identification of a Pivotal Residue for Determining the Block Structure-Forming Properties of Alginate C-5 Epimerases

Bidragsytere:
  • Annalucia Stanisci
  • Anne Tøndervik
  • Margrethe Gaardløs
  • Anders Lervik
  • Gudmund Skjåk-Bræk
  • Håvard Sletta
  • mfl.

Tidsskrift

ACS Omega
ISSN 2470-1343
e-ISSN 2470-1343
NVI-nivå 1

Om resultatet

Vitenskapelig artikkel
Publiseringsår: 2020
Volum: 5
Hefte: 8
Sider: 4352 - 4361
Open Access

Importkilder

Scopus-ID: 2-s2.0-85080878693

Beskrivelse Beskrivelse

Tittel

Identification of a Pivotal Residue for Determining the Block Structure-Forming Properties of Alginate C-5 Epimerases

Sammendrag

Alginate is a linear copolymer composed of 1→4 linked β-d-mannuronic acid (M) and its epimer α-l-guluronic acid (G). The polysaccharide is first produced as homopolymeric mannuronan and subsequently, at the polymer level, C-5 epimerases convert M residues to G residues. The bacterium Azotobacter vinelandii encodes a family of seven secreted and calcium ion-dependent mannuronan C-5 epimerases (AlgE1–AlgE7). These epimerases consist of two types of structural modules: the A-modules, which contain the catalytic site, and the R-modules, which influence activity through substrate and calcium binding. In this study, we rationally designed new hybrid mannuronan C-5 epimerases constituting the A-module from AlgE6 and the R-module from AlgE4. This led to a better understanding of the molecular mechanism determining differences in MG- and GG-block-forming properties of the enzymes. A long loop with either tyrosine or phenylalanine extruding from the β-helix of the enzyme proved essential in defining the final alginate block structure, probably by affecting substrate binding. Normal mode analysis of the A-module from AlgE6 supports the results.

Bidragsytere

Annalucia Stanisci

  • Tilknyttet:
    Forfatter
    ved Institutt for bioteknologi og matvitenskap ved Norges teknisk-naturvitenskapelige universitet

Anne Tøndervik

  • Tilknyttet:
    Forfatter
    ved Bioteknologi og nanomedisin ved SINTEF AS
Inaktiv cristin-person

Margrethe Gaardløs

  • Tilknyttet:
    Forfatter
    ved Institutt for bioteknologi og matvitenskap ved Norges teknisk-naturvitenskapelige universitet

Anders Lervik

  • Tilknyttet:
    Forfatter
    ved Institutt for kjemi ved Norges teknisk-naturvitenskapelige universitet

Gudmund Skjåk-Bræk

  • Tilknyttet:
    Forfatter
    ved Institutt for bioteknologi og matvitenskap ved Norges teknisk-naturvitenskapelige universitet
1 - 5 av 7 | Neste | Siste »