Cristin-resultat-ID: 2043510
Sist endret: 16. august 2022, 14:57
NVI-rapporteringsår: 2022
Resultat
Vitenskapelig Kapittel/Artikkel/Konferanseartikkel
2022

Detecting statistical interactions in immune receptor datasets

Bidragsytere:
  • Thomas Minotto
  • Ingrid Hobæk Haff og
  • Geir Kjetil Ferkingstad Sandve

Bok

Proceedings of the 36th International Workshop on Statistical Modelling
ISBN:
  • 978-88-5511-309-0

Utgiver

EUT Edizioni Università di Trieste
NVI-nivå 1

Om resultatet

Vitenskapelig Kapittel/Artikkel/Konferanseartikkel
Publiseringsår: 2022
Sider: 253 - 257
ISBN:
  • 978-88-5511-309-0

Klassifisering

Fagfelt (NPI)

Fagfelt: Matematikk
- Fagområde: Realfag og teknologi

Beskrivelse Beskrivelse

Tittel

Detecting statistical interactions in immune receptor datasets

Sammendrag

Recent progress in the understanding of immune receptors suggests that complex interactions between amino acids are important in determining binding to antigens. Yet, current methods focus mostly on constructing good predictors for the data with complex models, and less on the understanding of the underlying interaction effects. Here, we attempt to retrieve high-order statistical interactions in immune receptor data with different methods. We study performance at this task in a large simulation study, and how it depends on the order, amount and strength of the interactions, witness rate and sample size. The results show that pairwise interactions are easily retrieved, but model complexity harms detection. Interactions are better detected in larger samples, but the process is then slower.

Bidragsytere

Thomas Minotto

  • Tilknyttet:
    Forfatter
    ved Statistikk og Data Science ved Universitetet i Oslo

Ingrid Hobæk Haff

  • Tilknyttet:
    Forfatter
    ved Statistikk og Data Science ved Universitetet i Oslo

Geir Kjetil Ferkingstad Sandve

  • Tilknyttet:
    Forfatter
    ved Vitenskapelige beregninger og maskinlæring ved Universitetet i Oslo
1 - 3 av 3

Resultatet er en del av Resultatet er en del av

Proceedings of the 36th International Workshop on Statistical Modelling.

Torelli, Nicola; BELLIO, RUGGERO; MUGGEO, VITO. 2022, EUT Edizioni Università di Trieste. UdSdT, UdSdU, UdSdPVitenskapelig antologi/Konferanseserie
1 - 1 av 1