Endringer i tarmflora hos kreftpasienter

Både kreftkjemoterapi og antibiotikabehandling kan føre til mer antibiotikaresistente mikrober i tarmen og bidra til lekkasje til blodbanen hos kreftpasienter. Hovedformålet med piloten er å undersøke om nanoporesekvensering egner seg til å påvise behandlingspåførte endringer i tarmmikrobiomet hos disse pasientene. 5 pasienter med myelomatose vil bli inkludert. Fæcesprøve vil bli samlet inn før, under og etter behandling. DNA fra prøvene vil bli sekvensert ved bruk av shotgun metagenomic sequencing (nanopore sekvenseringsplattform) og på gullstandard plattformen innen nestegenerasjonssekvensering, Illumina. Sekvenseringsresultatene vil bli sammenlignet mhp sammensetning av mikrober og antibiotikaresistensgener. Klinisk data relatert til kreftbehandlingen vil bli samlet inn fra pasientjournal. Piloten vil den legge grunnlaget for større studier hvor vi kan undersøke hvilke kjemoterapi er mest skadelig og hvordan kombinasjonen kjemoterapi og ulik antibiotika påvirker tarmmikrobiotaen.