Helgenomsekvensering av SARS-CoV-2 virus: CoV-seq

Formålet med prosjektet er å helgenomsekvensere SARS-CoV-2 virus for å undersøke om den genetiske sammensetningen hos viruset kan forklare a) sykdomsforløp og b) om den kan brukes i smitteoppsporing og overvåking av COVID-19. Alle individer med postitiv test for SARS-CoV-2 i opptaksområdet til Akershus universitetssykehus er aktuelle for inklusjon. Arvemateriale fra viruset vil bli hentet fra diagnostiske prøver tatt hovedsakelig fra nese/svelg og hals og helgenomsekvensert vha nanoporesekvensering.Ved avdekking av sammenheng mellom genetiske egenskaper hos virus og sykdomsforløp, kan man predikere utfall til fremtidige smittede med dette viruset. Ved å kunne avdekke smitteveier/smitteoverføring kan man sette i gang rettede, forebyggende tiltak.