Klinisk betydning av mikrobegenetisk variasjon i pasienter med mistenkt sepsis – en Nor-GECCO-substudie

E. coli er den klart hyppigst forekommende mikroben i norske blodkulturer. Klinisk er det stor variasjon mellom pasienter med E.coli i blodkultur, fra mild sykdom til hyperakutt septisk sjokk og død. Denne variasjonen kan neppe forklares av vertsfaktorer alene. Norsk overvåkingssystem for antibiotikaresistens hos mikrober (NORM) har helgenomsekvensert 3254 norske E. coli blodkulturisolater, og resultatene er nylig publisert i The Lancet microbe (Gladestone et al, 2021). Dette unike materialet utgjør antagelig et av verdens største og mest komplette mikrobegenetiske bibliotek. Det kan gjøre oss i stand til å slå fast om genetiske trekk ved mikrobene har betydning for pasienten. Ved å retrospektiv samle inn en begrenset mengde kliniske opplysninger håper vi å kunne påvise om den genetiske variasjonen av E. coli har betydning for sykdommen forløp, hvilke pasientgrupper som rammes og hvilke fokus det er for infeksjonen Formål • Utforske sammenheng mellom Den genetiske versjonen av E. coli og demografi, klinisk bilde og klinisk utkomme. • Utforske sammenheng mellom spesifikke virulensgener med demografi, klinisk bilde og klinisk utkomme.