Cristin-resultat-ID: 2023932
Sist endret: 24. oktober 2022, 20:30
NVI-rapporteringsår: 2022
Resultat
Vitenskapelig artikkel
2022

Preprocessing Strategies for Sparse Infrared Spectroscopy: A Case Study on Cartilage Diagnostics

Bidragsytere:
  • Valeria Tafintseva
  • Tiril Aurora Lintvedt
  • Johanne Heitmann Solheim
  • Boris Zimmermann
  • Hafeez Ur Rehman
  • Vesa Virtanen
  • mfl.

Tidsskrift

Molecules
ISSN 1431-5157
e-ISSN 1420-3049
NVI-nivå 1

Om resultatet

Vitenskapelig artikkel
Publiseringsår: 2022
Volum: 27
Hefte: 3
Artikkelnummer: 873
Open Access

Importkilder

Scopus-ID: 2-s2.0-85123519541

Beskrivelse Beskrivelse

Tittel

Preprocessing Strategies for Sparse Infrared Spectroscopy: A Case Study on Cartilage Diagnostics

Sammendrag

The aim of the study was to optimize preprocessing of sparse infrared spectral data. The sparse data were obtained by reducing broadband Fourier transform infrared attenuated total reflectance spectra of bovine and human cartilage, as well as of simulated spectral data, comprising several thousand spectral variables into datasets comprising only seven spectral variables. Different preprocessing approaches were compared, including simple baseline correction and normalization procedures, and model-based preprocessing, such as multiplicative signal correction (MSC). The optimal preprocessing was selected based on the quality of classification models established by partial least squares discriminant analysis for discriminating healthy and damaged cartilage samples. The best results for the sparse data were obtained by preprocessing using a baseline offset correction at 1800 cm−1, followed by peak normalization at 850 cm−1 and preprocessing by MSC.

Bidragsytere

Valeria Tafintseva

  • Tilknyttet:
    Forfatter
    ved Institutt for fysikk ved Norges miljø- og biovitenskapelige universitet

Tiril Aurora Lintvedt

  • Tilknyttet:
    Forfatter
    ved Råvare og prosess ved NOFIMA
  • Tilknyttet:
    Forfatter
    ved Institutt for fysikk ved Norges miljø- og biovitenskapelige universitet

Johanne Heitmann Solheim

  • Tilknyttet:
    Forfatter
    ved Institutt for fysikk ved Norges miljø- og biovitenskapelige universitet

Boris Zimmermann

  • Tilknyttet:
    Forfatter
    ved Institutt for fysikk ved Norges miljø- og biovitenskapelige universitet

Hafeez Ur Rehman

  • Tilknyttet:
    Forfatter
    ved Institutt for fysikk ved Norges miljø- og biovitenskapelige universitet
1 - 5 av 15 | Neste | Siste »